Fontcoberta es troba al nord-est del Pla de Banyoles, a la capçalera de la riera Garrumbert, afluent del Terri. El terme també és drenat pel torrent de Vall-llobera, per la riera de la Farga, per la riera de Centenys i per la riera i l'estany d'Espolla.
© Portal Gironí d'Història i Genealogia (www.portalgironi.cat)